Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PLXNA1Q9UIW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNA1Q9UIW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA1Q9UIW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms