Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUFIP1Q9UHK0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms