Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18L2Q9UHA2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms