Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK2Q9UBU2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms