Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SUCLA2Q9P2R7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUCLA2Q9P2R7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUCLA2Q9P2R7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUCLA2Q9P2R7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms