Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS18Q9P253 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS18Q9P253 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms