Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL20A1Q9P218 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL20A1Q9P218 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL20A1Q9P218 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms