Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS2Q9NYR9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms