Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms