Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TCP11L1Q9NUJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TCP11L1Q9NUJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms