Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCND1Q9NSA2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCND1Q9NSA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms