Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
DUOX2Q9NRD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DUOX2Q9NRD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DUOX2Q9NRD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
DUOX2Q9NRD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms