Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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