Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3GLB2Q9NR46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3GLB2Q9NR46 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH3GLB2Q9NR46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3GLB2Q9NR46 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms