Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPHNQ9NQX3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPHNQ9NQX3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPHNQ9NQX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms