Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM9Q9NQV7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM9Q9NQV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms