Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID1IP1Q9NPA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MID1IP1Q9NPA3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms