Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC24A3Q9HC58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A3Q9HC58 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A3Q9HC58 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms