Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTD2Q9H8S5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTD2Q9H8S5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTD2Q9H8S5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTD2Q9H8S5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTD2Q9H8S5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTD2Q9H8S5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTD2Q9H8S5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTD2Q9H8S5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTD2Q9H8S5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms