Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGNBP2Q9H3C7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGNBP2Q9H3C7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGNBP2Q9H3C7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GGNBP2Q9H3C7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GGNBP2Q9H3C7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GGNBP2Q9H3C7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GGNBP2Q9H3C7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GGNBP2Q9H3C7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GGNBP2Q9H3C7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GGNBP2Q9H3C7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms