Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS11Q9H270 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS11Q9H270 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS11Q9H270 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS11Q9H270 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms