Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCSER1Q9C0I3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCSER1Q9C0I3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms