Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPO4Q9C0E2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPO4Q9C0E2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPO4Q9C0E2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPO4Q9C0E2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms