Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4CQ9C0C4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms