Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM3Q9BZL3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM3Q9BZL3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms