Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PCGF6Q9BYE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PCGF6Q9BYE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PCGF6Q9BYE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms