Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP85Q9BW27 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms