Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD3Q9BV44 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THUMPD3Q9BV44 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms