Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDFIP1Q9BT67 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDFIP1Q9BT67 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms