Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAAF1Q9BRP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAAF1Q9BRP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms