Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USB1Q9BQ65 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USB1Q9BQ65 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USB1Q9BQ65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms