Protein–RNA interactions for Protein: Q99705

MCHR1, Melanin-concentrating hormone receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCHR1Q99705 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCHR1Q99705 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCHR1Q99705 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCHR1Q99705 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCHR1Q99705 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCHR1Q99705 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCHR1Q99705 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCHR1Q99705 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms