Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT12Q99456 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT12Q99456 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms