Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSPAN18Q96SJ8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN18Q96SJ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms