Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN4Q96Q06 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLIN4Q96Q06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN4Q96Q06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN4Q96Q06 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms