Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD27Q96NW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD27Q96NW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD27Q96NW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms