Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD8Q96LT4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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