Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDHR1Q96JP9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDHR1Q96JP9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR1Q96JP9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms