Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHAMP1Q96JM3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAMP1Q96JM3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHAMP1Q96JM3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms