Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC12Q96J65 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
ABCC12Q96J65 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms