Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP2Q96HF1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFRP2Q96HF1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms