Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF18Q96CE8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM4SF18Q96CE8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms