Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM18Q96B42 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM18Q96B42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms