Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKL1Q969V6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MKL1Q969V6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKL1Q969V6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MKL1Q969V6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKL1Q969V6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKL1Q969V6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKL1Q969V6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKL1Q969V6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKL1Q969V6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKL1Q969V6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms