Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLNQ969V3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCLNQ969V3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLNQ969V3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms