Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX21Q969T3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX21Q969T3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms