Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP9XQ93008 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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USP9XQ93008 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP9XQ93008 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP9XQ93008 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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USP9XQ93008 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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USP9XQ93008 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP9XQ93008 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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