Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF7Q92985 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRF7Q92985 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF7Q92985 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF7Q92985 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms