Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD5Q8TDI0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms