Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELQQ8TDG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELQQ8TDG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms